V súčasnosti pôsobí ako docent a prednosta Ústavu lekárskej informatiky a simulátorovej medicíny na Lekárskej fakulte UPJŠ v Košiciach. Je tiež predsedom Akademického senátu Lekárskej fakulty UPJŠ v Košiciach. Profesionálne a výskumné oblasti záujmu Jaroslava Majerníka sú orientované na biomedicínske inžinierstvo, medicínsku informatiku a elektronickú podporu vzdelávania. Je autorom a spoluautorom 12 knižných publikácií a viac ako 250 odborných a vedeckých, ktoré boli citované viac ako 250-krát. Podieľal sa na riešení 43 výskumných projektoch vrátane 15 medzinárodných grantov a grantov EÚ v oblasti vzdelávania, biomechaniky a informatiky. Je členom ESMAC, Koordinačnej rady MEFANET, ISACA, redakčnej rady časopisu MEFANET Journal, redakčnej rady časopisu Multimedia Technology a redakčnej rady Portálu multimediálnej podpory výučby klinických a zdravotníckych odborov UPJŠ LF.