Marián Duffek ukončil štúdium na Lekárskej fakulte Univerzity P.J.Štefánika v Košiciach, odbor všeobecné lekárstvo. Atestáciu z chirurgie 1. stupňa získal ma Slovenskej akadémii postgraduálnej medicíny a v roku 2007 získal aj atestáciu z gastroenterologickej chirurgie na Slovenskej zdravotníckej univerzite. Od roku 1997 pôsobí na chirurgii Ústrednej vojenskej nemocnici v Ružomberku, v súčasnosti ako primár centrálnych operačných sál.