Matej pracuje ako člen tímu letovej prevádzky Medzinárodnej vesmírnej stanice, konkrétne európskeho modulu Columbus, v Nemeckom stredisku pre letectvo a kozmonautiku (DLR). Náplňou jeho práce je monitorovanie a riadenie modulu Columbus a zabezpečenie plynulého chodu výskumu a práce astronautov na palube stanice. Predtým pracoval na Slovensku v odvetví robotiky, umelej inteligencie, a nanosatelitov. Absolvoval program Young Graduate Trainee v technickom stredisku ESTEC Európskej vesmírnej agentúre (ESA). Je tiež spoluzakladateľom startupu GroundCom, ktorý sa venuje poskytovaniu infraštruktúry pre komunikáciu so satelitmi, a ktorý je inkubovaný ESA. Popri práci sa nezávisle venuje výskumu v odvetví vesmírnych letov s ľudskou posádkou a systémovým štúdiám konceptov habitácie Mesiacu, Marsu a Venuše.